MMTK () – zestaw narzędzi programowych do modelowania molekularnego. MMTK jest to oprogramowanie open source z wiodącym językiem Python, do wspomagania powszechnych działań w modelowaniu cząsteczek.
Pakiet zawiera: konstrukcje systemów cząsteczkowych szczególnie dla białek i polinukleotydów Nieskończone systemy dla periodycznych warunków brzegowych geometryczne operacje na współrzędnych Wizualizacje przy użyciu zewnętrznych PDB i VRLM przeglądarek animację dynamicznych trajektorii AMBER 94 oddziaływania polowe z wieloopcyjnym wybieraniem elektrostatycznych interakcji siłowe pola deformacyjne dla szybkich NM obliczeń dla polipeptydów minimalizacje energii w wersjach: stopniowej i ciągłej Molekularną dynamikę z wyborem ustaleń termostatycznych, barostatycznych i odległościowych NM profil analizy operacje torów dopasowywanie ładunków punktowych obliczanie powierzchni cząsteczek IO sprzężenie do innych programów
Linki zewnętrzne Strona domowa
Kategoria:Oprogramowanie chemiczne Kategoria:Dynamika molekularna