KEGG () – zbiór dostępnych w Internecie bioinformatycznych baz danych, które zawierają informacje nt. genomów i genów, szlaków metabolicznych (reakcji chemicznych i enzymów) i metabolitów. Znajdują się one w osobnych sieciach: białkowej, genetycznej i biochemicznej.
Informacje podstawowe KEGG została zapoczątkowana przez japoński program ludzkiego genomu (Laboratorium Kanehisa w Instytucie Badań Chemicznych) w 1995 r.. Jej twórcy uważają KEGG za komputerowe odzwierciedlenie układu biologicznego. Baza danych KEGG ma wiele zastosowań: modelowanie, symulacja, przeglądanie i pobieranie danych.
Bazy danych
KEGG zawiera w sobie 5 baz danych: KEGG Atlas KEGG BRITE KEGG Genes KEGG Ligand – zawiera informacje o związkach i reakcjach chemicznych, które biorą udział w zachodzących w komórce procesach; składa się z następujących części: Compound Drug Glycan Reaction RPAIR (Reactant pair alignments) Enzyme KEGG Pathway – zawiera informacje na temat sieci komórkowych interakcji molekularnych i ich wariantów charakterystycznych dla konkretnych organizmów; jej części to: Metabolism Genetic Information Processing Environmental Information Processing Cellular Processes Human Diseases Drug development
Zobacz też Comparative Toxicogenomics Database
Przypisy
Linki zewnętrzne Strona główna bazy KEGG Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes O KEGG w MetaBase
Kategoria:Biologiczne bazy danych