Od 2017 Brunnbauer sprawuje funkcję dyrektora Instytutu Leibniza.
Badania Brunnbauera koncentrują się na historii społecznej Europy Południowo-Wschodniej w XIX i XX wieku, w tym szczególnie na historii nacjonalizmu, problematyce mniejszościowej, historii rodziny i historiografii państw bałkańskich.
Członkostwo w stowarzyszeniach i organizacjach Association for Slavic, East European and Eurasian Studies (ASEEES) Deutsche Gesellschaft für Osteuropakunde (DGO) Deutscher Hochschulverband International Association for Southeast European Anthropology (InASEA) Johann Gottfried Herder-Forschungsrat Südosteuropa-Gesellschaft (SOG) Verband der Osteuropahistoriker/innen
Publikacje 2004: Gebirgsgesellschaften auf dem Balkan. Wirtschaft und Familienstrukturen im Rhodopengebirge (19./20. Jahrhundert). Wiedeń-Kolonia-Weimar: Böhlau. 2007: Die sozialistische Lebensweise.” Ideologie, Gesellschaft, Familie und Politik in Bulgarien, 1944–1989. Wieden.: Böhlau 2011: Bulgarische Übersetzung: „Socialističeski način na život”. Ideologija, obštestvo,