We wrześniu 2006 Londoño zastąpił Ríosa na stanowisku pierwszego trenera CDS Vida. Nie zdołał poprawić gry drużyny i na koniec sezonu zajął z nią ostatnie miejsce w tabeli. Słaby początek nowego sezonu poskutkował w styczniu 2007 zwolnieniem szkoleniowca. Później Londoño powrócił do Kolumbii, gdzie trenował amatorskie drużyny, a także był zatrudniony w instytucji Servicio Nacional de Aprendizaje (SENA). Jako selekcjoner reprezentacji SENA zajął pierwsze miejsce w turnieju Juegos de Ascundeportes. Organizował konferencje dydaktyczne dla amatorskich i profesjonalnych szkoleniowców piłkarskich, ponownie był również asystentem Jairo Ríosa – kolejno w honduraskich Platense (2011) i Real Sociedad (2013) oraz salwadorskiej Águili (2014). W międzyczasie trenował kolumbijski amatorski zespół Estrellas del Sur (2012).
W październiku 2014 Londoño został następcą Mauro Reyesa w roli trenera honduraskiego CD Real Sociedad. W tym samym, jesiennym sezonie Apertura 2014 zdobył z nim wicemistrzostwo Hondurasu. W kolejnych miesiącach jego podopieczni spisywali się jednak znacznie słabiej – we wrześniu 2015 szkoleniowiec złożył rezygnację ze stanowiska wskutek kiepskich wyników (tylko pięć zwycięstw w ostatnich 24 meczach).