Zdaniem „starych” sędziów sytuacja, w której najważniejszym sądem w kraju kieruje osoba nieposiadająca legitymacji do wydawania wyroków ze względu na brak gwarancji niezależności od władzy politycznej pogłębia chaos prawny i podważa autorytet wymiaru sprawiedliwości. W wywiadzie dla stacji TVN24 Manowska stwierdziła, że nie jest zainteresowana wyborem na prezydenta kandydata, który kwestionowałby status sędziów powołanych po 2018 roku. Wypowiedź padła w czasie, gdy Sąd Najwyższy rozpatrywał protesty wyborcze. Politycy trzeciego rządu Donalda Tuska uznali ją za naruszenie zasady apolityczności sędziego, wskazując, że podważa zaufanie do bezstronności SN przy stwierdzaniu ważności wyboru prezydenta. Manowska odpowiadała, że jej wypowiedź dotyczyła obiektywnego zagrożenia dla statusu ok. 3000 sędziów, a nie osobistej preferencji wyborczej. Według stanu na marzec 2026 wobec Manowskiej toczy się pięć postępowań prokuratorskich. Prokuratura Krajowa wystąpiła o uchylenie jej immunitetu. Postępowania dotyczą: w kierunku popełnienia przez nią czynu z art. 231 kodeksu karnego, czyli niedopełnienia obowiązków służbowych – dotyczy zarzucanego niewykonania orzeczenia Sądu Okręgowego w Olsztynie z 10 maja 2021 roku, w kierunku popełnienia przez nią czynu z art.