Jaenicke angażuje się w ochronę zwierząt i środowiska, w tym orangutanów na Borneo. Współpracując z ZDF, nakręcił filmy dokumentalne o życiu zagrożonych gatunków zwierząt, takich jak orangutany, niedźwiedzie polarne i rekiny. Za program W akcji dla rekinów 23 stycznia 2010 organizacja ochrony rekinów Sharkproject przyznała mu tytuł „Strażnika Rekinów Roku 2010”. W 2014 jego produkcja Hannes Jaenicke: Im Einsatz für… (Hannes Jaenicke: W akcji dla…) została uhonorowana „Nagrodą Specjalną Festiwalu Filmowego NaturVision” na Festiwalu Filmowego NaturVision.
W latach 1999–2001 był żonaty z Nicole. W latach 2004–2008 pozostawał w związku z aktorką Tiną Bordihn. Następnie związał się z aktorką Stephanie KrogmannHochzeit nach dem Baby–Glück?„Freizeit Spass”, nr 41/30 września 2025, str.