Kolejne lata przebiegały na uzyskaniu większej samodzielności od konsystorza Kościoła Bawarii w Monachium, co osiągnięto na przełomie lat 1848-1849Evangelische Kirche der Pfalz - Geschichte.
Koniec XIX wieku i początek XX wieku przyniosły wewnętrzne konflikty pomiędzy dominującą w kościele opcją racjonalistyczno-liberalną, a konserwatywną, a także ruchami przebudzeniowymi.
W 1933 kierownictwo kościołem przejęli Niemieccy Chrześcijanie, włączając go do powołanego przez narodowych socjalistów Niemieckiego Kościoła Ewangelickiego (Deutsche Evangelische Kirche). Odbudowa kościoła po 1945 została ukształtowana przez działajność Kościoła Wyznającego.
Ordynację kobiet na duchownych wprowadzono w 1958.
Rozwój kościoła i organizacji religijnych rozpoczęty po wojnie został zahamowany po 1995 w związku ze spadkiem ilości wiernych oraz związanym z tym zmniejszeniem zakresu finansowania działalności. Spowodowało potrzebę szukania oszczędności, koncentrację prowadzonych usług i zmniejszenie ich zakresu, zwiększenie roli pracy wolontariuszy.