We wrześniu 2021 reprezentował Kościół Polskokatolicki w Rzeczypospolitej Polskiej podczas uroczystej konsekracji arcybiskupa Utrechtu Bernda Walleta.
Po śmierci bp Wiktora Wysoczańskiego, Rada Synodalna Kościoła Polskokatolickiego w RP powierzyła mu w dniu 28 kwietnia 2023 roku obowiązki ordynariusza diecezji warszawskiej, przewodniczącego Rady Synodalnej i p.o. zwierzchnika Kościoła Polskokatolickiego w RP.
13 czerwca 2023 roku Synod Kościoła Polskokatolickiego w RP obradujący w Ośrodku im. Eduarda Herzoga w Konstancinie Jeziornie, wybrał ks. inf. Andrzeja Gontarka na biskupa-zwierzchnika Kościoła (jednocześnie z urzędu także ordynariusza diecezji warszawskiej oraz przewodniczącego Rady Synodalnej Kościoła). W głosowaniu uzyskał 42 z 45 głosów. Święcenia biskupie przyjął 9 września 2023 w katedrze polskokatolickiej św. Marii Magdaleny we Wrocławiu. Głównym konsekratorem był bp Dick Schoon z diecezji Haarlemu Kościoła Starokatolickiego w Niderlandach, zaś współkonsekratorami bp Pavel Benedikt Stránský, zwierzchnik Kościoła Starokatolickiego w Czechach oraz bp Johannes Okoro, biskup-senior Kościoła Starokatolickiego w Austrii.