W styczniu 2006 po konflikcie z m.in. posłem Krzysztofem Filipkiem został wykluczony z Samoobrony RP. Oskarżył następnie władze tego ugrupowania o wymuszanie pieniędzy od kandydatów w wyborach. W marcu 2006 współtworzył partię pod nazwą Samoobrona Ruch Społeczny, której został przewodniczącym. Funkcję tę pełnił do sierpnia 2006. W lipcu 2007 współtworzył Samoobronę Odrodzenie (powstałą na bazie Samoobrony RS). W przedterminowych wyborach parlamentarnych w 2007 bez powodzenia kandydował jako jej przedstawiciel z listy Prawa i Sprawiedliwości do Sejmu (otrzymał 3838 głosów). W tym samym roku współtworzył Ogólnopolskie Porozumienie Związków Zawodowych Rolników i Organizacji Rolniczych, którego został przewodniczącym. Następnie utworzył Związek Zawodowy Rolników Polskich.
W wyborach samorządowych w 2010 bez powodzenia kandydował do rady powiatu siedleckiego z listy KWW „Porozumienie na rzecz Powiatu”. W kwietniu 2015 stanął na czele nowo powołanego ugrupowania politycznego Ruch Społeczny Rzeczypospolitej Polskiej, które poparło Pawła Kukiza w wyborach prezydenckich w tym samym roku. W wyborach parlamentarnych w 2015 Sławomir Izdebski bezskutecznie kandydował z jego ramienia do Senatu w jednym z mazowieckich okręgów. Wiosną 2024 był jednym z liderów protestów rolników, którzy przeprowadzili m.in.