Publicysta W 2012 roku Shapiro został redaktorem Breitbart News, konserwatywnego serwisu internetowego założonego przez Andrew Breitbarta. W marcu 2016 roku Shapiro zrezygnował z posady redaktora Breitbart News gdy, jak sam to określił, pracownicy wspomnianego portalu nie poparli dziennikarki Michelle Fields w jej oskarżeniu, jakoby Corey Lewandowski, były szef kampanii prezydenta Donalda Trumpa, miał ją zaatakować. Po odejściu Shapira na portalu opublikowano komentarz: „Ben Shapiro zdradza wiernych czytelników Breitbarta w pogoni za posadą w Fox News”. Komentarz ten został później usunięty.
7 lutego 2013 roku Shapiro opublikował artykuł, powołując się na anonimowe źródło w Senacie, z którego wynikało, że grupa pod nazwą „Przyjaciele Hamasu” znalazła się w gronie zagranicznych kontrybutorów kampanii politycznej Chucka Hagela, byłego senatora USA a niedoszłego Sekretarza Obrony Stanów Zjednoczonych, nominowanego przez prezydenta Baracka Obamę. Jednakże parę tygodni później dziennikarz „Slate”, David Weigel, poinformował, że nie ma dowodów na istnienie takiej grupy.