Sezon 1948/1949 był 1. sezonem w historii klubu od momentu jego powstania 14 grudnia 1948 roku. Górnik brał udział w rewanżowej rundzie Klasy A Śląska Opolskiego (marzec i kwiecień 1949 roku) oraz w eliminacjach wstępnych o miejsce w II lidze sezonu 1949.
Działalność klubu Pod koniec 1948 roku katowicki magazyn "Sport" zapowiedział połączenie istniejących na terenie Zabrza klubów górniczych w jedno towarzystwo sportowe. 14 grudnia 1948 roku utworzono Górniczy Zakładowy Klub Sportowy Górnik, będący fuzją Pogoni Zabrze, Zjednoczenia, Concordii i Skry. Stanowisko prezesa objął działacz robotniczy Filip Sieroń.
Klasa A Górnik rozpoczął rozgrywki od rundy rewanżowej najniższej klasy rozgrywkowej - Klasy A w obrębie Śląska Opolskiego odnosząc trzy zwycięstwa i dwie porażki. Następnie brał udział w eliminacjach o miejsce w II lidze, podczas których uległ drużynie Stali Bobrek z Bytomia w spotkaniu barażowym.