Pracowała również jako dramaturżka teatralna przy przedstawieniach reżyserowanych przez Małgorzatę Wdowik, Martę Ziółek, Wojciecha Grudzińskiego i Hanę Umedę
Jej książka Przemilczane. Seksualna praca przymusowa w czasie II wojny światowej była nominowana w konkursie o Nagrodę im. Teresy Torańskiej i została wybrana Genderową Książką Roku 2018. W 2020 roku Przemilczane uhonorowano Mauthausen-Memorial-Forschungspreis razem z pracami autorstwa Josefa Villi i Danieli Henke.
W 2021 roku Joanna Ostrowska została uhonorowana nagrodą Orfeo Iris 2021 ILGCN (International Rainbow Culture Network) za badania i publikacje dotyczące historii osób nieheteronormatywnych w czasie II wojny światowej.
W 2022 nominowana do Nagrody Literackiej „Nike” za reportaż historyczny Oni. Homoseksualiści w czasie II wojny światowej (znalazła się w finale Nagrody), do Nagrody im. Prof. Tomasza Strzembosza, do Nagrody im. Jerzego Giedroycia oraz do Genderowej Książki Roku 2021. Laureatka Nagrody Nike Czytelników 2022. Jej książka Ślady. Historia pewnego archiwum została nominowana do Wyszehradzkiej Nagrody Literackiej 2025.
Członkini Unii LiterackiejCzłonkowie UL.