Od 1917 pełnił funkcję sekretarza w Komisji Fotograficznej Polskiego Towarzystwa Krajoznawczego. W 1920 służył ochotniczo w Wojsku Polskim. Od 1925 pracował we własnym zakładzie fotograficznym, przy ulicy Marszałkowskiej w Warszawie, specjalizującym się w fotografii krajoznawczej. Fotografie Henryka Poddębskiego były prezentowane na wielu wystawach fotograficznych: indywidualnych i zbiorowych, w Polsce i za granicą. Jego fotografie były wielokrotnie doceniane nagrodami, wyróżnieniami, na wystawach pokonkursowych, w kraju i na świecie. Jego spuścizna to archiwum fotograficzne liczące ponad 22 tysiące fotografii.
Henryk Poddębski został 12 września 1944 wywieziony przez Niemców z Warszawy (w czasie powstania warszawskiego) i zmarł w hitlerowskim obozie w Vaihingen an der Enz (por. ). Jego grób (symboliczny) znajduje się na cmentarzu Powązkowskim w Warszawie (kwatera 70-3-3,4). Fotografie Henryka Poddębskiego znajdują się w zbiorach (m.in.) Muzeum Warszawy, Narodowego Archiwum Cyfrowego, Biblioteki Narodowej w Warszawie, Muzeum Miasta Gdyni i Instytutu Sztuki Polskiej Akademii Nauk.
Ordery i odznaczenia Krzyż Oficerski Orderu Odrodzenia Polski (pośmiertnie, 2019) Brązowy Krzyż Zasługi (1938)