W 1948 r. Dowker obroniła doktorat w Radcliffe College (Cambridge, Massachusetts) pod kierunkiem Witolda Hurewicza. W 1947 r. opublikowała pracę dyplomową Invariant measure and the ergodic theorems, w 1948 roku otrzymała tytuł PhD. W latach 1948–1949 pracowała jako doktorant w Institute for Advanced Study w Princeton, New Jersey. W czasie kiedy zaczął się nasilać makkartyzm, kilku przyjaciół pary Dowker ze społeczności matematycznej spotkały prześladowania, jeden z nich został aresztowany. W 1950 r. para zdecydowała się wyemigrować do Wielkiej Brytanii.
W 1951 r. Dowker pracowała jako profesor na Uniwersytecie w Manchesterze, a następnie (od 1954 r.) jako profesor w Imperial College w Londynie. W tym czasie była promotorem między innymi Billa Parry’ego, który opublikował swoją pracę dyplomową w 1960 r. Prawdopodobnie była wtedy jedyną osobą w kraju, która pracowała nad teorią erdogyczną. Współpracowała również przy niektórych swoich pracach z węgierskim matematykiem Paulem Erdősem.