Od 1991 Wojciech Kotowski był rzeczywistym członkiem Stowarzyszenia Dziennikarzy Rzeczypospolitej Polskiej. Był także członkiem Polskiego Towarzystwa Kryminalistycznego. W 1997 bez powodzenia ubiegał się o mandat posła na Sejm w okręgu podwarszawskim z listy Unii PracyWyniki głosowania w wyborach do Sejmu w 1997 roku..
Wojciech Kotowski był współtwórcą i redaktorem naczelnym czasopisma Paragraf na Drodze. Prawne i kryminalistyczne problemy ruchu drogowego wydawanego przez Wydawnictwo Instytut Ekspertyz Sądowych im. Prof. Jana Sehna w Krakowie. Jako redaktor naczelny ww. periodyku był jednym z inicjatorów akcji Kto wpada w oczy, nie wpada pod koła mającej na celu zwiększenie bezpieczeństwa uczniów poruszających się po zmroku na niedostatecznie oświetlonych ulicach Jest także współtwórcą miesięcznika Orzecznictwo Sądów Apelacyjnych, w Radzie Naukowej którego obecnie zasiada. W 2008 Naczelna Rada Adwokacka powierzyła Wojciechowi Kotowskiemu stałą rubrykę pt. Problematyka wypadków drogowych w wydawanym czasopiśmie Palestra.