Stowarzyszenie oficjalnie odcięło się od autorstwa tej instalacji, zaznaczając, że nie miało wpływu na jej treść.

Spór o definicję mowy nienawiści Działalność przedstawicieli stowarzyszenia, w tym wypowiedzi krytyczne wobec hierarchów Kościoła katolickiego, budziła sprzeciw środowisk konserwatywnych, które określały je jako atak na wartości chrześcijańskie. Stowarzyszenie argumentowało z kolei, że wypowiedzi te mieszczą się w dopuszczalnych ramach publicznej debaty i wolności słowa.

Kontrowersje dotyczące finansowania W debacie publicznej pojawiały się także spory o źródła i formy finansowania działalności stowarzyszenia. Przykładowo w budżecie miasta Gdańska na 2020 rok uwzględniono środki na realizację projektów promujących równość i tolerancję, wśród których wymieniano dotacje dla Tolerado na działania wspierające osoby LGBT i wolontariat, co wywołało głosy sprzeciwu części radnych miejskich.

W mediach pojawiały się również informacje o wsparciu zagranicznym, m.in. w kontekście grantów od międzynarodowych programów, które część komentatorów uznawała za wątpliwe z punktu widzenia lokalnej polityki społecznej.