Na poziomie szkoły podstawowej i gimnazjum uczyła się w , natomiast później uczęszczała do szkoły średniej . Uzyskawszy 1580 na 1600 punktów w teście SAT ukończyła tę szkołę rok wcześniej jako pierwsza uczennica w jej historii. W 2020 roku została przedwcześnie przyjęta na Uniwersytet Stanforda, alma mater swojej matki, jednak plany rozpoczęcia studiów przełożyła na czas po igrzyskach olimpijskich w 2022 roku. W 2022 roku została studentką pierwszego roku fizyki kwantowej na Uniwersytecie Stanforda, ponadto podjęła tam też studia na kierunku stosunki międzynarodowe. Przed rozpoczęciem studiów w okresach letnich wyjeżdżała do Pekinu w celu uczestniczenia w z matematyki. Podczas studiów została członkinią bractwa . W 2024 roku dołączyła do programu wymiany z Uniwersytetem Oksfordzkim. W czerwcu 2026 roku ukończyła studia na Uniwersytecie Stanforda.
Życie pozasportowe Kwestia narodowości i obywatelstwa Eileen Gu pod względem przynależności narodowej określa siebie jako „mieszane dziecko”, ponadto w mediach wypowiadała się o sprawie swojej narodowości w ten sposób: „Kiedy jestem w Stanach Zjednoczonych, jestem Amerykanką, ale kiedy jestem w Chinach, jestem Chinką”.