grecki klucz zduplikowane: składa się z dwóch domen tego samego zwoju Nadrodzina: Trypsyno-podobne proteazy serynowe [50494] Rodzina: Proteazy eukariotyczne [50514] Białko: Trypsyna (ogen) [50515] Gatunek: Człowiek (Homo sapiens) [TaxId: 9606] [50519]
Po wpisaniu w oknie wyszukiwania zagadnienia "Hemoglobin +człowiek" (po angielsku) jako jeden z wyników otrzymamy (po angielsku):
Root: scop Klasa: Białka "All beta" [46456] Zwój: Globino-podobne [46457] rdzeń: 6 helis; złożony liść, częściowo otwarty. Nadrodzina: Globin-like [46458] Rodzina: Globiny [46463] Białka wiążące hem Białko: Hemoglobina, podjednostka alfa [46486] Gatunek: Człowiek (Homo sapiens) [TaxId: 9606] [46487]
Następcy SCOP Prototypowy system klasyfikacji SCOP2 ma za zadanie przywiązywać większą uwagę do ewolucyjnej złożoności pochodzenia struktury białka. W przeciwieństwie do SCOP nie posiada więc prostej hierarchii lecz sieć powiązań między nadrodzinami białek, reprezentując ich relacje strukturalne i ewolucyjne. Przykłady takich powiązań strukturalno-ewolucyjnych to: permutacje kołowe, fuzje domen i zanikanie domen. W związku z tym między domenami nie ma ściśle określonych granic, są raczej definiowane przez swoje relacje z najbardziej podobnymi do siebie strukturami. Od lutego 2015 prototyp SCOP2 klasyfikuje 995 wpisów PDB.
Przypisy
Kategoria:Biologiczne bazy danych Kategoria:Struktura białek