W 1998 roku nastąpiła reorganizacja sieci obszarów chronionego krajobrazu w ówczesnym województwie gorzowskim – uchylone zostało rozporządzenie ustalające obszary chronione z 1992 roku (powtarzające m.in. wspomniany wcześniej obszar utworzony w 1984) i powstało 12 nowych obszarów chronionego krajobrazu oznaczonych symbolami literowymi od „A” do „L”. Na liście tej na pierwszym miejscu znalazł się obszar „A /Dębno-Gorzów/” obejmujący ochroną 21 893 ha (z czego 18 487 ha stanowiły lasy).
Po reformie administracyjnej w 1999 roku obszar przecięty został granicą województw zachodniopomorskiego i lubuskiego. Ochrona obszaru w zachodniopomorskim została podtrzymana bez żadnych zmian rozporządzeniem Wojewody Zachodniopomorskiego.
W 2003 przyjęte zostały ujednolicone zakazy we wszystkich obszarach chronionego krajobrazu w województwie, skorygowane w 2005 (wówczas też w akcie prawnym podana została powierzchnia obszaru w województwie zachodniopomorskim – 10 800 ha). W 2007 obszar tej formy ochrony określono jako 11 060 ha.