Air/Magokoro o, kimi ni W Air/Magokoro o, kimi ni, gdy japońskie strategiczne siły samoobrony atakują NERV, Asuka zostaje umieszczona w Jednostce 02, która jest zanurzona w jeziorze w Geofroncie, dla jej ochrony. Kiedy jest bombardowana przez ładunki głębinowe, Asuka oświadcza, że nie chce umrzeć, i w chwili jasności uświadamia sobie, że dusza jej matki znajduje się w Evie i chroni ją przez cały czas. Dziewczyna odzyskuje swoją tożsamość, wynurza się i pokonuje JSSDF, zanim natyka się na masowo produkowane Evy. Chociaż skutecznie unieszkodliwia wszystkich dziewięciu przeciwników, moc Jednostki 02 wyczerpuje się, a nieskończona moc silników S² w masowo produkowanych Evach (które to silniki pozwalają im zachować funkcjonalność pomimo poważnego uszkodzenia lub okaleczenia) w końcu pozwala im wypatroszyć i zniszczyć jednostkę 02 używając ich repliki Włóczni Longinusa. Shinji następnie przygotowuje się do rozpoczęcia Trzeciego Uderzenia w nieokreślonej scenie, konfrontuje się z Asuką, która kłóci się z nim i odrzuca jego prośby o pomoc„To jedna z najbardziej intensywnych scen w filmie i perwersyjna subwersja dynamiki między tymi dwoma w serii. Asuka mówi Shinjiemu, że chce ją, bo boi się Misato i Rei.