Wiosną 1942 został zaprzysiężony do Armii Krajowej jako kapelan placówki Hyżne przez jej dowódcę, ppor. Mieczysława Chendyńskiego, przyjmując pseudonim Żbik (do AK przystąpiło także dwóch z braci Bossowskiego, Rudolf i Stanisław). Był w wikarówce gospodarzem szkoleń, odpraw i kursów podoficerskich, udzielał kwatery ppor. Chendyńskiemu. Z czasem przyjął rolę zastępcy komendanta placówki. Pomagał swemu dowódcy w wystawianiu fałszywych kenkart i metryk dla poszukiwanych przez Niemców cywilów i uczestników konspiracji. Jednocześnie uczył w pięciu szkołach, wygłaszał liczne kazania; jego kazanie z okazji dziesiątej rocznicy koronacji obrazu Matki Bożej Łaskawej 8 września 1942 było inwigilowane przez gestapowca w cywilu. Po śmierci związanego z Hyżnem gen. Władysława Sikorskiego latem 1943 odprawił symboliczny pogrzeb Naczelnego Wodza, również pod obserwacją Gestapo.