Jeszcze w trakcie całej rywalizacji w związku z ustaleniem nowego systemu rozgrywek o mistrzostwo Wojska Polskiego (w piłce nożnej, koszykówce, siatkówce, hokeju na lodzie) decyzją Ministerstwa Obrony Narodowej postanowiono, że wojskowe drużyny sportowe OWKS i GWKS nie będą brały udziału w państwowych ligach sportowych, a pion wojskowy w tych dziedzinach miał reprezentować CWKS. Wskutek tego GWKS Rzeszów został rozwiązany. Tym samym drużyna piłkarska nie przystąpiła do sezonu II ligi w 1954, a w jej miejsce został promowany zespół Ogniwa Wrocław.

Ponadto w edycji Pucharu Polski 1953/1954 GWKS jako reprezentant województwa rzeszowskiego miał zapewnione miejsce w fazie na szczeblu centralnym, jednak wskutek na powyższe decyzje odgórne nie przystąpił do rozgrywek. W jego miejsce do rywalizacji w PP przystąpiła drużyna Stali Rzeszów w składzie wzmocnionym byłymi zawodnikami GWKS. Pierwotnie anonsowano także, że Stal Rzeszów analogicznie zajmie miejsce GWKS w II lidze, co jednak nie stało, się, gdyż w 1954 w II lidze występowało Ogniwo Wrocław.

Piłkarzami GWKS byli m.in.