Styl mały|Słowacki plakat do filmu Ptaszki, sieroty i głupcy (1969). mały|Słowacki plakat do filmu Tysiącletnia pszczoła (1983). Jakubisko bywa nazywany „słowackim Fellinim”. Chronologicznie filmy Jakubiska wpisują się w okres Czechosłowackiej Nowej Fali, jednak jego charakterystyczny styl łatwo odróżnić na tle pokolenia. Jego twórczość cechuje bajkowa, magiczna atmosfera z elementami gry i humoru. Choć Jakubisko czerpał inspiracje z tradycji słowackiej wsi i folkloru, jego filmy odbiegają od konformizmu części słowackich reżyserów tworzących w czasach komunistycznych. Jakubisko wykorzystywał motywy ludowe, by eksperymentować z formą i testować nowe możliwości budowania narracji.
Twórczość 1960: Posledný nálet 1960: Každý den má svoje jméno 1961: Strieborný vietor 1962: Prvá trieda 1963: Mlčení (pol. Milczenie) 1965: Déšť (pol. Deszcz) 1965: Čekají na Godota (pol. Czekając na Godota) 1967: Kristove roky (pol. Chrystusowe lata) 1968: Zbehovia a pútnici (pol. Dezerterzy i pielgrzymi) 1969: Vtáčkovia, siroty a blázni (pol. Ptaszki, sieroty i głupcy) 1970/1990: Dovidenia v pekle, priatelia!