W 1574 utracił na rzecz hrabiów Oldenburga Jever. Licząc na odzyskanie tego terytorium w 1580 Edzard zawarł sojusz z królem Hiszpanii Filipem II Habsburgiem, toczącym wówczas wojnę z Niderlandami i potrzebującym sojuszników w tym regionie, bezpośrednim skutkiem tego układu była coroczna płatność Hiszpanów na rzecz Edzarda. Mimo to dług hrabstwa pod panowaniem Edzarda rósł i ten coraz częściej zwracał się do jego stanów o wsparcie finansowe. Jednocześnie był to okres rozwoju portu i miasta Emden. W efekcie w 1595 doszło do rewolucji emdeńskiej – mieszczanie, wsparci przez prowincje niderlandzkie, powstali przeciwko hrabiemu i odnieśli sukces. Edzard nie zdołał ich pokonać i utracił kontrolę nad miastem.
Rodzina 1 października 1558 odbył się ślub Edzarda z Katarzyną, córką króla Szwecji Gustawa I Wazy. Z tego małżeństwa pochodziły następujące dzieci: Małgorzata (1560–1588), żona kolejno palatyna reńskiego Ludwika VI, margrabiego Badenii-Durlach Ernesta Fryderyka oraz księcia Saksonii-Lauenburga-Ratzeburga Juliusza Henryka, Anna (1562–1621), Enno III (1563–1625), następca Edzarda jako