W 1918 roku powstała nowa wersja samolotu, nazwana Caudron R.12. Różniła się ona od pierwowzoru zastosowaniem mocniejszych silników o mocy 220 kW (300 KM) każdy. Zbudowany w jednym egzemplarzu samolot testowany był między latem 1918 a jesienią 1919 roku, jednak przyrost osiągów nie był na tyle znaczący, by maszyna trafiła do produkcji i dalsze prace nad konstrukcją zostały przerwane.

Użycie Wprowadzony w lutym 1918 roku do służby w Aéronautique Militaire początkowo miał pełnić funkcję samolotu do współpracy z armią i bombowego, jednak najbardziej pożyteczny okazał się w wersji Caudron R.11A3 jako myśliwiec eskortujący. Od lipca 1918 roku używany był w takim charakterze do eskorty bombowców Breguet XIV podczas dziennych nalotów, odnosząc przy tym spore sukcesy. Straty wypraw bombowych osłanianych przez R.11 spowodowane przez myśliwce wroga były znacznie mniejsze niż straty zadane ogniem artylerii przeciwlotniczej. Na liście francuskich asów znajduje się czterech strzelców pokładowych z R.11, z których najskuteczniejszym został sierż. Mario Vitalis z dorobkiem ośmiu zestrzeleń. Prócz tego maszyna używana była do zadań rozpoznawczych.