Urząd piastował do rozpoczęcia II wojny światowej.
Do 1939 był członkiem Stowarzyszenia Urzędników Państwowych oraz członkiem Zarządu Związku Oficerów Rezerwy.
Podczas okupacji niemieckiej mieszkał wraz z rodziną w Milanówku, a podczas pierwszych lat po wyzwoleniu we Wrocławiu. Po powrocie do Łodzi spotkały go represje związane z pełnieniem przez niego funkcji w administracji państwowej w II Rzeczypospolitej. Na skutek działań Wydziału Śledczego Wojewódzkiego Urzędu Bezpieczeństwa Publicznego w Łodzi Franciszek Denys został w 1950 oskarżony, osądzony i skazany na podstawie dekretu z 22 stycznia 1946 „O odpowiedzialności za klęskę wrześniową i faszyzację życia państwowego w Polsce” na ponad rok więzienia. W 1954 został skazany na trzy lata pozbawienia wolności oraz utratę praw publicznych i obywatelskich praw honorowych za skierowanie do miejsca odosobnienia w Berezie Kartuskiej działaczy Komunistycznej Partii Polski i Komunistycznego Związku Młodzieży Polski.
Spoczywa na cmentarzu na Mani w Łodzi, przy ul. Solec 11 (kwatera 8-30-47).
Odznaczenia
Srebrny Krzyż Zasługi (9 listopada 1929)M.P. z 1930 r. nr 13, poz.