Proces wyboru miejsca organizacji W przeciwieństwie do Konkursu Piosenki Eurowizji, w którym wygrywający nadawca publiczny ma pierwszeństwo do organizacji konkursu w kolejnym roku, telewizja triumfująca w Konkursie Piosenki Eurowizji Junior nie otrzymuje automatycznie prawa do organizacji następnego konkursu. W latach 2014–2017 zwyciężający nadawca państwowy posiadał pierwszeństwo do wyrażenia zainteresowania organizacji kolejnej edycji. 15 października 2017 Europejska Unia Nadawców oznajmiła powrót do zasady braku pierwszeństwa w 2018, zaznaczając, że dzięki temu pomoże to wybranemu nadawcy przygotować się do organizacji z większym zapasem czasu.
Do organizacji pierwotnie zgłosiła się Hiszpania, jednak później wycofała swoją kandydaturę. Organizacją konkursu był zainteresowany także kazachski nadawca, jednak ze względu na brak pełnego członkostwa EBU nie mógł on zorganizować konkursu w Kazachstanie, przez co jego propozycja została odrzucona. 5 marca 2020 EBU potwierdziła, że konkurs odbędzie się w Polsce. Telewizja Polska była pierwszą telewizją w historii, która zorganizowała finał konkursu dwa lata z rzędu. mały|216x216px|Siedziba Telewizji Polskiej, miejsce organizacji konkursu Pod koniec lutego pojawiły się informacje, że konkurs odbędzie się w Krakowie.