Ten powolny proces utworzył obecne jezioro Lake McDonald.

Życie w jeziorze thumb|left|240px|Odpoczywająca pomiędzy kamieniami ryba Salvelinus confluentus Temperatura wody w jeziorze nigdy nie przekracza 10 stopni Celsjusza na powierzchni, z tendencją spadkową w głąb. To powoduje bardzo znikome tworzenie się planktonu. Dlatego też woda odznacza się wysoką przejrzystością, a szczegóły dna można obserwować do głębokości ponad 9 m.

Skrajnie niski poziom żyzności oraz niska temperatura, a także minerały dostarczane przez otaczające skały powodują, że również fauna jeziora jest bardzo uboga. W przeszłości w jeziorze głównie występowały ryby Salvelinus confluentus należące do łososiowatych (Salmonidae). Jednak obecnie są one rzadkością, natomiast po wytrzebieniu naturalnie występującego gatunku wprowadzono szereg gatunków pstrągów i palii, które zadomowiły się zarówno w jeziorze, jak i w szeregu dopływów.