Z powodu budowy trzeciego korytarza kolejowego w 2012 r. zamknięto ulicę Prokopovą. Aby trolejbusy nie musiały zjeżdżać do zajezdni Cukrovarská objazdem przez Bory, oddano do użytku nowy, w przybliżeniu długi na 0,75 km odcinek sieci na ulicy U Trati od skrzyżowania z ulicami Doudlevecką/Prokopovą, przez most Milénia do skrzyżowania z ulicą Mikulášską. Nowo wybudowany odcinek został oddany do użytku 29 marca 2012 r. Po ponownym otwarciu ulicy Prokopovej 30 czerwca 2012 r. linie trolejbusowe powróciły na swoje trasy, a nowy odcinek sieci stał się trasą techniczną, służącą trolejbusom w czasie objazdów i remontów oraz do wyjazdu i zjazdu do zajezdni. Planowane jest także poprowadzenie przedłużenia trakcji trolejbusowej ulicami Železničną i Lobezską.
W grudniu 2013 r. zmieniono nazwy wielu przystanków. Zmieniono zasady pisowni nazw (np. U plynárny → U Plynárny) oraz usunięto nazwy osiedli (np. Bory, Heyrovského → Sídliště Bory, lub Doubravka, Zábělská → Doubravka)
29 sierpnia 2014 r. uroczyście oddano do użytku nowo wybudowaną zajezdnię Karlov, która służy jako zajezdnia autobusowo–trolejbusowa. Starą zajezdnię na ulicy Cukrovarskiej przekazano miastu.