Jan Józef Kostrzak (ur. 8 marca 1946 w Józefowie koło Radziejowa, zm. 29 kwietnia 2004 w Toruniu) – polski historyk mediewista, dyplomata.
Życiorys Syn Czesława (zm. 1962) i Reginy z domu Czupryńskiej; najstarszy z czwórki rodzeństwa. Ukończył liceum w Radziejowie. Zaczął studia w szkole oficerskiej w Kaliszu, które porzucił. Po odbyciu służby wojskowej (1964–1966) pracował w dziale organizacji i zarządzania Zakładów Włókien Sztucznych Elana w Toruniu. W 1967 zaczął zaocznie studiować historię na tamtejszym uniwersytecie. W 1972 uzyskał stopień magistra na podstawie pracy „Stanowisko Inflant wobec konfliktów zbrojnych polsko-krzyżackich w pierwszej połowie XV wieku” napisanej pod kierunkiem Mariana Biskupa.
Następnie rozpoczął pracę naukową jako asystent w toruńskiej Pracowni Historii Pomorza Wschodniego Instytutu Historii Polskiej Akademii Nauk, gdzie zgłębiał początki systemu stanowego w Inflantach pod władzą zakonu krzyżackiego. Tego też dotyczyła jego praca doktorska obroniona w Instytucie Historii PAN w Warszawie w 1982, wydana następnie w postaci książkowej. Awansował na adiunkta. W ramach stypendium badawczego wyjeżdżał do Berlina (1984–1986), Monachium (1987) i Tallinna (1989). Przygotowywał habilitację nt.