Systematyka W obrębie gatunku wyodrębnia się kilkanaście podgatunków: D. p. bellula Kellogg, 1946 D. p. boliviae Thomas, 1917 D. p. callida Bangs, 1901 D. p. chiapensis Goldman, 1913 D. p. chocoensis Allen, 1915 D. p. columbiana Bangs, 1898 D. p. dariensis Goldman, 1913 D. p. isthmica Alston, 1876 D. p. nuchalis Goldman, 1917 D. p. pallidiventris Bole, 1937 D. p. pandora Thomas, 1917 D. p. punctata Gray, 1842 D. p. richmondi Goldman, 1917 D. p. underwoodi Goldman, 1931 D. p. urucuma Allen, 1915 D. p. variegata Tschudi, 1845 D. p. yucatanica Goldman, 1913 D. p. yungarum Thomas, 1910 D. p. zamorae Allen, 1915
Kariotyp Garnitur chromosomowy aguti środkowoamerykańskiego (podgatunku D. p. variegata) tworzą 32 pary (2n=64) chromosomów; FN=124.
Tryb życia Aguti środkowoamerykański wiedzie dzienny tryb życia, ale można czasem napotkać go także w nocy. Jest zwierzęciem naziemnym. Żyje w parach. Samica rodzi 1–2 młodych. Młode stają się samodzielne w wieku 4 do 5 miesięcy.
Ekologia Jest roślinożercą.