Kanał Mrs2 reguluje splicing RNA. pory importujące białka - scharakteryzowano dwa systemy transportu białek w wewnętrznej błonie mitochondrialnej. Por zbudowany z kompleksu białek Tim23, który dedykowany jest dla białek posiadających terminalną sekwencję NH2- celująca do mitochondriów. Natomiast por kanału zbudowany z Tim22 i kofaktorów odpowiedzialny jest za transport białek, które nie zawierają sekwencji sygnałowej, są natomiast wbudowywane do błony wewnętrznej mitochondriów. Oba białka występują w odpowiednich kompleksach jako dimery i są w stanie nieaktywnym podczas braku białek do transportowania. Nadejście białka powoduje aktywację poru. anionowe selektywne kanały jonowe – najczęściej opisywanym kanałem jest kanał anionowy wewnątrz błonowy IMAC (ang. Inner Membrane Anion Channel). Otwarcia kanału zależne są od napięcia, przy potencjałach dodatnich kanał wykazuje większą aktywność w porównaniu do ujemnych napięć. nieselektywne mitochondrialne mega-kanały – mitochondrialny mega-kanał MPTP (ang. Mitochondrial Permeability Transition Pore) jest skomplikowaną wielobiałkową strukturą. Kanał jest nieselektywny i w towarzystwie jonów wapnia i nieorganicznych związków fosforu tworzy por, który może przepuszczać substancje rozpuszczone o masie cząsteczkowej do 1,5 kDa. MPTP charakteryzuje się wysokim przewodnictwem.