Historia poznania gatunku Gatunek został odkryty podczas wyprawy prowadzonej przez kubańskiego zoologa Orlando H. Garrido w lutym i marcu 1970. Zoolog chciał sprawdzić informacje pochodzące od rybaków z La Coloma dotyczące występowania tam odrębnego gatunku hutii. Zoolog udał się na wyspę Cayos de San Felipe, w zachodniej części Archipelagu Canarreos, około 30 km na południe od portu La Coloma, w prowincji Pinar del Rio. Schwytał wówczas cztery zwierzęta. Na ich podstawie Varona i Orlando H. Garrido opisali gatunek w 1970 na łamach „Poeyana”, periodyku kubańskiej Akademii Nauk jako Capromys sanfelipensis. W tym samym roku naukowiec udał się na Cayo Real, gdzie także miały być widziane hutie, ale nie znalazł poszukiwanych zwierząt. M. sanfelipensis jest więc znana tylko z typowej lokalizacji na Cayo Juan Garcia. Od października 1970 naukowcy nie schwytali ani nawet nie zaobserwowali żadnego okazu.
Budowa ciała Skrytohutia krótkoucha jest gryzoniem o średniej wielkości. Jest bardzo podobna do innych gatunków rodzaju Mesocapromys. Wzór zębowy I C P M 20 = 1 0 1 3 1 0 1 3