W 2010 roku uzyskała tytuł profesora w zakresie nauk technicznych. Jest profesorem zwyczajnym w Instytucie Inżynierii Środowiska i Biotechnologii (dawniej w Samodzielnej Katedrze Biotechnologii i Biologii Molekularnej) Wydziału Przyrodniczo-Technicznego Uniwersytetu Opolskiego (UO). Jest członkiem Senatu UO.
W latach 2008–2016 pełniła funkcję prodziekana Wydziału Przyrodniczo-Technicznego Uniwersytetu Opolskiego.
Prof. Maria Wacławek wypromowała 5 doktorów.
Przez wiele lat badania naukowe prowadziła razem ze swoim mężem profesorem Witoldem Wacławkiem oraz z ich doktorantami i habilitantami. Dotyczyły one głównie monitoringu i biomonitoringu środowiska – jego skażenia zarówno metalami ciężkimi, jak i radionuklidami (po awarii czarnobylskiej). Wieloletnia współpraca naukowa Marii i Witolda z grupą badawczą prof. Karela Kolara (University of Hradec Kralove, Hradec Králové, Czech Republic) i z prof. Mariną Frontasievą (Joint Institute for Nuclear Research, Dubna, Russia) zaowocowała wieloma grantami oraz wspólnymi publikacjami.