Często bywał w Tatrach, przyczynił się do budowy Śląskiego Domu w Wielickiej Dolinie i własnym kosztem zbudował jedną ze ścieżek turystycznych ze Smokowca do Wodospadów Zimnej Wody (Droga Wagnera, Wagner-Weg).
Jego syn Gerhard był naczelnym lekarzem III Rzeszy () w randze ministra zdrowia Rzeszy (Reichsgesundheitsführer), odpowiedzialnym za zbrodnie nazistowskie, i współtwórcą rasistowskich ustaw norymberskich, dających podwaliny pod przyszły Holokaust.
Upamiętnienia mały|lewo|200x200px|Grób Wagnera na cmentarzu ewangelickim w Chorzowie W 1897 August Otto, po dokonaniu pierwszego wejścia na Litworowy Szczyt, dla uczczenia zasług Wagnera, nazwał go Wagnerspitze (Wagner-csúcs) i następnie nazwę tę stosował w kilku kolejnych wydaniach swego przewodnika (od 1898), jednakże nazwa nie utrwaliła się w niemieckiej i węgierskiej literaturze o Tatrach.