1998 – 10 listopada w proteście przeciwko wydanej pozytywnej opinii, członkowie Rady Gminy Puńsk zawiesili wykonywanie mandatu radnego do czasu uchylenia opinii. 1998 – 16 listopada Rada Gminy Puńsk zawiesiła swoją działalność. Radni poczuli się urażeni decyzją Wojewody suwalskiego o przeznaczeniu części gminnego ośrodka zdrowia na strażnicę graniczną. Przeciwko lokalizacji strażnicy wystąpiła ze sprzeciwem mniejszość litewska (stanowiąca w gminie ok. 80 proc.). 1998 – 23 listopada na odcinku Podlaskiego Oddziału SG nielegalnie przekroczyła granicę państwową w ciągu ostatnich lat największa grupa nielegalnych imigrantów. Liczyła 113 obywateli różnych narodowości, między innymi z Afganistanu, Pakistanu, Indii. Grupa została zatrzymana w okolicach Suwałk, Sejn i Puńska. Litewscy przemytnicy postanowili przerzucić grupę około 180 imigrantów, pozostałych zatrzymały służby litewskie. 1998 – konflikt o nową strażnicę na odcinku litewskim narastał. Litwini nie zamierzali oddać ośrodka zdrowia, doprowadzili do oflagowania budynku. Dla rozwiązania konfliktu zaangażowali się posłowie, senatorowie oraz władze centralne kraju. 1999 – 18 lutego Straż Graniczna nie zamierza wycofać się z planów ulokowania strażnicy w Puńsku, mimo protestów tamtejszej społeczności.