W latach 50. XX wieku Pogoń występowała w klasie A, klasie wojewódzkiej i klasie wydzielonej. W 1956 klub zajął szóste miejsce w tabeli międzywojewódzkiej ligi katowicko-opolskiej. Rok później występował w I lidze okręgowej opolskiej, w której sezon zakończył na czwartym miejscu na dziewięć zespołów. W 1958 Pogoń została zdegradowana do klasy A, po czym sekcja tenisa stołowego została rozwiązana.
Szachy Sekcja szachów Pogoni Prudnik została założona w grudniu 1946. Jej organizatorem i pierwszym kierownikiem był Kazimierz Zubik. Spotkania szachistów odbywały się w budynku klubowym przy ul. Zamkowej 2. Pierwsze rozgrywki szachowe w Prudniku odbyły się w sali restauracji przy ul. Kościuszki pomiędzy drużyną miejscowej straży więziennej i sekcją Pogoni. Zakończyły się wynikiem 8:2 dla Pogoni. Drugie spotkanie, zorganizowane w świetlicy Pogoni, między szachistami Pogoni i Stowarzyszeniem Kupców Polskich, zakończyły się przegraną Pogoni 2:3. W kolejnych latach sekcja została rozwiązana.
W 1954 sekcję reaktywowano z inicjatywy Juliusza Kuszkę. W sezonie 1954 klub przystąpił do rozgrywek ligi okręgowej. W 1957/1958 zakwalifikował się do finału wojewódzkiego, w którym zajął czwarte miejsce w tabeli.