Badania kontraktowe realizowane są w wyspecjalizowanych laboratoriach należących do JCI, obejmujących m.in. analizy biologiczne, instrumentalne, spektroskopowe, mikrobiologiczne oraz badania z zakresu kontroli jakości. Część działalności JCI obejmuje również recepturowanie i produkcję kontraktową kosmetyków oraz badania prowadzone zgodnie z obowiązującymi normami jakości i systemami zarządzania.
Istotnym elementem struktury JCI jest Centrum Badań Klinicznych JCI, zlokalizowane na terenie Life Science Parku, które prowadzi badania kliniczne (I, II, III oraz IV fazy.) oraz projekty badawczo‑rozwojowe we współpracy z podmiotami krajowymi i zagranicznymi.
Historia W latach 2009–2013 działalność Jagiellońskiego Centrum Innowacji (JCI) koncentrowała się przede wszystkim na tworzeniu zaplecza infrastrukturalnego i organizacyjnego dla rozwoju przedsiębiorczości technologicznej w obszarze nauk przyrodniczych. Oferta spółki obejmowała w tym okresie głównie wynajem specjalistycznych powierzchni laboratoryjnych, realizację projektów grantowych oraz wsparcie finansowe innowacyjnych firm w ramach funduszu zalążkowego JCI Venture.