Čestmír Loukotka (ur. 12 listopada 1895 w Chrášťanach, zm. 13 kwietnia 1966 w Pradze) – czeski językoznawca, etnograf i amerykanista. Zajmował się komparatystyką języków indiańskich Ameryki Południowej. Jego córką była pisarka Jarmila Loukotková.
Życiorys Studiował lingwistykę i etnologię amerykańską na Sorbonie w Paryżu. W 1914 r. został zmuszony do przerwania studiów. Później przebywał tamże na pobytach studyjnych. W 1953 r. obronił pracę kandydacką na temat klasyfikacji ceramiki południowoamerykańskiej. Dopiero od 1950 r. mógł całkowicie poświęcić się badaniom naukowym. Najpierw pracował w praskim Muzeum Náprstek, a w 1954 r. został zatrudniony w Instytucie Etnografii i Folklorystyki Czechosłowackiej Akademii Nauk. W 1957 r. został zaproszony na roczny pobyt studyjny w Brazylii, gdzie wziął udział w wyprawie badawczej poświęconej pozostałościom po plemieniu Xetá.
W swojej działalności naukowej koncentrował się na klasyfikacji języków autochtonicznych Ameryki Południowej. Zajmował się także językami australijskimi, papuaskimi i tajwańskimi. Do jego zainteresowań należały również kultura i historia rdzennych mieszkańców Ameryki.