Podczas okupacji niemieckiej w szkole prowadzono tajne nauczanie i wydano 45 konspiracyjnych matur. Powstała tam komórka organizacyjna Armii Krajowej, której Helena Rzeszotarska była członkiem. W 1942 nie uzyskała ona od władz niemieckich pozwolenia na dalsze prowadzenie przy ul. Konopackiej prywatnej szkoły powszechnej, a w 1943 Niemcy zamknęli również jej prywatną szkołę gospodarczą.
Szkoła została reaktywowana po wyzwoleniu Pragi w 1944. W 1949 placówka została upaństwowiona. Helena Rzeszotarska nie skorzystała z propozycji odkupienia przez władze oświatowe wyposażenia szkoły i przekazała je nieodpłatnie na rzecz utworzonej w jej miejsce szkoły Państwowej Żeńskiej Szkoły Ogólnokształcącej Stopnia Podstawowego i Licealnego nr 17. Pozostała w niej także jako nauczycielka języka polskiego. W 1959 szkoła została przeniesiona z ul. Konopackiej na nowo wybudowane osiedle Praga III, do nowego budynku przy ul. Burdzińskiego, gdzie kontynuowała działalność pod nazwą L Liceum Ogólnokształcącego z Oddziałami Integracyjnymi im. Ruy Barbosy.
Helena Rzeszotarska została pochowana na cmentarzu Powązkowskim w Warszawie (kwatera 28-4-16/17).
Odznaczenia Krzyż Oficerski Orderu Odrodzenia Polski (1958).