W 1861 roku wróciła do Haderslev, gdzie kupiła dom na Laurids Skaus Gade. W przybudówce założyła swoje studio. Przez wiele lat mieszkała ze swoją przyjaciółką, pianistką Marie Roll. Wspierała młodych artystów, Hansa Fuglsang i Augusta Wilckensa.
W 1904 roku spędziła trochę czasu na wyspie Fanø, malując m.in. tamtejszy budynek kościoła.
Charlotte von Krogh zmarła w Haderslev 25 listopada 1913 roku. Chociaż w tamtym czasie miasto było niemieckie, to jej pogrzeb odbywał się w języku duńskim. Na uroczystości obecnych było wielu miejscowych artystów.
Charakterystyczne dla jej malarstwa są sceny wnętrz z Haderslev i okolicy oraz z wyspy Fanø.
Miasto Husum jedną z ulic nazwało jej imieniem: Charlotte-von-Krogh-Straße.
Wybrane dzieła mały|Charlotte Christiane von Krogh podczas pracy (ok. 1890)