W randze nauczyciela rzeczywistego uczył tam języków łacińskiego, greckiego, polskiego
Podczas I wojny światowej 28 sierpnia 1916 został przydzielony ze Stanisławowa do macierzystego Gimnazjum w Sanoku, a 19 czerwca 1917 został zatwierdzony w zawodzie nauczycielskim i otrzymał tytuł c. k. profesora. W roku szkolnym 1916/1917 w szkole uczył języka polskiego i języka łacińskiego. Do 1918 był ponownie profesorem gimnazjum stanisławowskiego. Został odznaczony austriackim Krzyżem Jubileuszowym dla Cywilnych Funkcjonariuszów Państwowych.
thumb|240px|Symboliczne upamiętnienie Franciszka Juna na grobowcu rodzinnym w Sanoku Po odzyskaniu przez Polskę niepodległości nadal był profesorem zakładu w Stanisławowie, przemianowanego na I Państwowe Gimnazjum im. Mieczysława Romanowskiego, ucząc łaciny i greki, był też zawiadowcą gabinetu archeologicznego••••. Równolegle sprawował stanowisko kierownika Prywatnego Gimnazjum Żeńskiego im. Elizy Orzeszkowej z prawem publiczności (założonego w 1906 przez TNSW)•••. W Państwowym Gimnazjum uczył do września 1927, po czym urlopowany na rok 1927/1928 pełnił wyłącznie obowiązki kierownika ww. Gimnazjum Żeńskiego. Od roku szkolnego 1928/1929 ponownie był profesorem Gimnazjum im. Romanowskiego. 15 lipca 1929 został mianowany tymczasowym kierownikiem tego gimnazjum.