Od 1992 roku podjęła współpracę z drugim maltańskim dziennikiem The Malta Independent. W tym czasie wspierała Zielonych (Alternativa Demokratika). W swojej pracy zajmowała się tematem korupcji na Malcie. Jej artykuły doprowadzały do bezpośredniej konfrontacji mediów z prominentami Malty, począwszy od lidera Partii Pracy Alfreda Santa i jego separacji małżeńskiej, aż po zarzuty handlu narkotykami, stawiane synowi dowódcy sił zbrojnych. W 1996 roku po raz pierwszy antagoniści posunęli się do drastycznych kroków w stosunku do jej osoby. Poderżnięto gardło jej psu i położono go na progu domu. Podpalono również drzwi do domu w Bidniji.
W 2006 roku doszło do pierwszego zamachu na życie Galizii. Nieznani sprawcy, na tyłach jej domu, podpalili dwa stosy opon wypełnionych benzyną. Niedługo potem, przez pomyłkę, podłożono bombę pod samochód sąsiada.
W marcu 2008 roku Daphne Galizia założyła blog Running Commentary. W krótkim czasie stał się jedną z najpopularniejszych stron internetowych Malty, osiągając blisko 400000 odsłon. Oficjalny start miał miejsce 2 marca 2008 roku o godzinie 2:02.
Jej publikacje doprowadziły do przedterminowych wyborów parlamentarnych na Malcie w 2017 roku.