Metody obliczeniowe wspomagające modelowanie struktur złożonych cząsteczek RNA.
Dorobek naukowy Jest współautorem szeregu specjalizowanych algorytmów, efektywnych narzędzi i szeroko wykorzystywanych serwerów obliczeniowych służących modelowaniu i kompleksowej analizie struktur przestrzennych cząsteczek biologicznych, a w szczególności RNA, np. system RNAComposer umożliwia automatyczne modelowanie struktur 3D RNA na podstawie sekwencji nukleotydów. Współpracuje w ramach międzynarodowej inicjatywy RNA-Puzzles tworząc rozwiązania: (a) pozwalające ekspertom skutecznie udoskonalać proces modelowania struktur 3D złożonych cząsteczek RNA oraz (b) wspomagające automatyzację procesu ewaluacji modeli 3D RNA zgłoszonych w konkursie. Publikuje artykuły w takich czasopismach jak m.in. „Bioinformatics”, „Nucleic Acids Research”, „ACM Computing Surveys”, „BMC Bioinformatics”, „RNA”, „International Journal of Applied Mathematics and Computing Science”.
Nagrody i wyróżnienia W 2019 r. został finalistą dziewiętnastej edycji Nagród Naukowych tygodnika Polityka w dziedzinie „Nauk Technicznych”. W 2020 r.