Następnie rozpoczęła naukę na Uniwersytecie Wisconsin, gdzie uzyskała tytuły: Bachelor’s degree w dziedzinie nauk humanistycznych (1882), Bachelor of Science w 1884 i Master of Science w 1887. W 1889 rozpoczęła naukę na Uniwersytecie Johnsa Hopkinsa, a cztery lata później doktoryzowała się.
Pracowała najpierw jako asystentka geologa, a od 1909 jako geolog w USGS. Była też współredaktorką magazynu American Geologist. Jej badania naukowe skupiały się głównie na wyjaśnieniu budowy i struktury skał wulkanicznych (na przykład ryolitu) w South Mountain w stanie Pensylwania. Na podstawie tych badań w 1896 roku powstała książka jej autorstwa zatytułowana The Ancient Volcanic Rocks of South Mountain, Pennsylvania. W 1906 roku „American Men of Science” umieścił ją na liście 100 najlepszych geologów w kraju. Florence założyła również instytut geologii w Bryn Mawr College, na którym wykładała przez 33 lata. Opublikowała ponad 40 artykułów naukowych na temat petrografii i geomorfologii.
Zmarła 18 czerwca 1945.
Upamiętnienie Jej imię nosi między innymi jeden z kraterów na Wenus, planetoida (6084) Bascom, jezioro polodowcowe oraz Florence Bascom Geoscience Center, będące częścią United States Geological Survey.
Publikacje Florence Bascom jest autorką lub współautorką m.in.