Komunikacja odbywa się również z poziomu regionalnego. W Polsce Stowarzyszenie Rada Ogrodów Botanicznych i Arboretów, zrzeszając przedstawicieli poszczególnych ogrodów botanicznych, tworzy krajową sieć ogrodów. Stowarzyszenie jako jedna z 23 europejskich krajowych sieci ogrodów botanicznych reprezentuje interesy polskich ogrodów botanicznych w międzynarodowej sieci ogrodów – European Botanic Gardens Consortium (EBGC).
Europejskie Konsorcjum Ogrodów Botanicznych zostało utworzone w 1994 r. w celu planowania ogólnoeuropejskich inicjatyw dotyczących ogrodów botanicznych, w szczególności w kontekście wdrażania Konwencji o Różnorodności Biologicznej i innych europejskich strategii. Konsorcjum spotyka się dwa razy w roku, a spotkania organizowane są w ogrodach członkowskich. Od przedstawicielami krajowymi dla Polski w Europejskim Konsorcjum Ogrodów Botanicznych są: dr hab. Justyna Wiland-Szymańska prof. UAM (dyrektor Ogrodu Botanicznego UAM w Poznaniu) oraz dr Paweł Kojs (dyrektor Śląskiego Ogrodu Botanicznego), zastępując tym samym pełniącego wcześniej tę ważną funkcję prof. dra hab. Jerzego Puchalskiego, który sprawował ją przez ponad 16 lat.