Religijnych Stowarzyszeń (DGAR) było zarejestrowanych ponad 9 tysięcy związków wyznaniowych.
Konstytucja Meksyku gwarantuje rozdział państwa od kościoła, oraz wolność wyznania. W raporcie Departamentu Stanu USA z 2018 roku księża katoliccy i inni przywódcy religijni nadal są celem i ofiarami zabójstw, prób wymuszeń, gróźb śmierci, porwań i zastraszania przez zorganizowane grupy przestępcze. Według Katolickiego Centrum Multimedialnego (CMC), Meksyk jest najbardziej brutalnym krajem dla duchownych w Ameryce Łacińskiej.
Historia Po hiszpańskim podboju w bitwie pod Otumbą (1520), imperium Azteków zostało poddane misji Kościoła katolickiego, który sprawował władzę równą, jeśli nie większą niż władza rządów wiceregionalnych. Pierwsza misja franciszkańska przybyła do Meksyku w roku 1524. Uniwersytet Meksykański został założony pod patronatem Kościoła w roku 1553. W 1572 osiedlili się tutaj jezuici.
Kościół rzymskokatolicki ustanowił arcybiskupstwo Meksyku w 1546 roku. Do czasu utworzenia arcybiskupstwa Gwatemali w 1743 roku, wszystkie diecezje w kontynentalnej Ameryce Hiszpańskiej na północ od Kostaryki, były podporządkowane Meksykowi.