W II turze poparł Rafała Trzaskowskiego z PO.
28 czerwca tego samego roku rada krajowa Polski 2050 zatwierdziła decyzję o zakończeniu ścisłej współpracy z PSL w ramach TD (przy czym utrzymany został klub TD w Senacie i wielu samorządach; TD pozostała także m.in. w nazwach klubów parlamentarnych obu partii, z nazwy klubu Polski 2050 człon ten został usunięty w październiku tego samego roku). Ponadto z zasiadania w zarządzie zrezygnowała II wiceprzewodnicząca partii Agnieszka Buczyńska, którą zastąpiła Adriana Porowska. 8 lipca Polskę 2050 opuściła posłanka Izabela Bodnar. 24 lipca Marta Cienkowska objęła urząd ministra kultury i dziedzictwa narodowego, natomiast zlikwidowano zajmowany przez Adrianę Porowską urząd ministra ds. społeczeństwa obywatelskiego. Agnieszkę Baranowską na funkcji sekretarza generalnego partii zastąpił z początkiem sierpnia 2025 Robert Sitnik. 5 sierpnia tego samego roku o opuszczeniu klubu parlamentarnego Polski 2050 poinformował zawieszony wcześniej poseł Tomasz Zimoch, a 16 października powrócił do niego Adam Gomoła. Także w październiku wiceprzewodniczącym partii przestał być Maciej Żywno.