Formacja thumb|Jedna z form skalnych w obrębie Kameni Kukli (2010) Kameni Kukli jest powstało przez długotrwałą erozję skał wulkanicznych o różnych rodzajach: andezyty i tufy. Silniejsze, bardziej zwarte skały (ignimbryty) powoli ulegają erozji i chronią spodnie warstwy miękkich tufów. Charakterystyczny wygląd skałom nadały długotrwałe wpływy atmosferyczne – opady atmosferyczne, zmiany temperatury oraz wietrzenie. Procesy te, które rozpoczęły się kilkadziesiąt tysięcy lat temu, trwają nadal, a niektóre formacje są stopniowo niszczone, z kolei inne tworzą się. Dzięki temu skały trwale zmieniają swoje kształty. Jednak ten proces jest bardzo powolny i nie można go zauważyć w ciągu miesiąca lub roku.
W pobliżu Kameni Kukli znajdowało się jezioro. Wraz z wyschnięciem zbiornika wodnego rozpoczęło się modelowanie formacji pod wpływem czynników egzogenicznych. Podobne rezerwaty znajdują się na wyspie Lesbos w Grecji (Muzeum Historii Naturalnej Skamieniały Las) i w Chemnitz w Niemczech (Skamieniały Las).