Po powrocie do Yorkshire Massee szczególnie zainteresował się grzybami. Wykonywał ich rysunki, które zwróciły uwagę M.C. Cooke’a, dyrektora mykologii w Kew Gardens. Po przeprowadzce do Londynu Massee rozpoczął serię ambitnych publikacji na temat grzybów, jednocześnie prowadząc publiczne wykłady, a także krótko pracując w Muzeum Historii Naturalnej w Londynie. Gdy w 1893 r. Cooke przeszedł na emeryturę, Massee zastąpił go na stanowisku głównego asystenta w katedrze roślin zarodnikowych, i pracował tu aż do przejścia na emeryturę w 1915 r. Po przejściu na emeryturę przeprowadził się do Sevenoaks.
George Massee był jednym z założycieli Brytyjskiego Towarzystwa Mykologicznego. W 1896 r. został wybrany na jego pierwszego prezesa i pełnił tę funkcję do 1898 r. W 1902 r. został odznaczony Honorowym Medalem Wiktorii. W latach 1899–1903 był prezesem klubu mikroskopowego Quekett.